Um retrato permanente do seu projeto
Aquela bela mensagem que todos nós gostamos de receber: “Parabéns,
seu artigo foi aceito para publicação na revista XXXXX”. Trabalho
terminado, certo? É hora de encaixotar tudo e partir para outra
empreitada científica? Não! Antes disso precisamos registar nosso código
de modo que ele possa ser rastreado facilmente, citado e, acima de tudo,
reproduzível de modo que quem o faça chegue nas mesmas conclusões que
chegamos em nosso artigo. Porém, seu código está no GitHub, e volta e
meia ele é modificado, ou por algum motivo técnico, instabilidade de
servidor ou até mesmo porque você decidiu revisitá-lo e modificar um
pouco esse código. A questão é, como fazer com que seu código possa ser
registrado e guardado com segurança e de maneira permanente? Para isso
utilizamos algum repositório para armazenamento permanente.
Aqui irei mostrar como isso pode ser feita a partir da utilização do
Zenodo, mas outros repositórios
permanentes de dados e códigos estão disponíveis por aí, por exemplo
Dryad.
Para armazenar seu código no Zenodo, a primeira coisa a ser feita é
criar uma conta nele. A minha sugestão é que esta conta seja criada
através da sua conta do GitHub, isso faz com que o Zenodo já tenha
conexão com seus repositórios, incluindo aquele que pretende fazer o
armazenamento permanente.
Acessando seus repositórios via Zenodo
Para ver os seus repositórios através do Zenodo basta acessar a aba
GitHub via zenodo, como mostrado na seta da Figura abaixo
Ao acessar a aba GitHub via Zenodo, todos os seus repositórios
públicos irão aparecer, portanto, é importante que o repositório que
você pretende fazer o armazenamento permanente dos dados seja público,
como mostrado na imagem abaixo
O primeiro passo é habilitar o acesso do Zenodo ao repositório de
interesse. Como mostrado na própria página do Zenodo. Em seguida você
deve fazer um release do seu repositório, mas o que é
isso? Como o próprio nome diz, o release é um lançamento do repositório,
é como se fosse uma fotografia do repositório inteiro em um dado
momento. Fazemos isso, por exemplo, quando temos uma versão estável de
um pacote estatístico, ou quando submetemos o nosso manuscrito para uma
revista ou repositórios de preprints. O release é importante pois é a
partir dele que será criado o DOI (Digital Object Identifier), que é
como um RG do seu repositório, um número único pelo qual ele pode ser
identificado na internet.
Para criar um release clique no botão verde na figura seguinte. Ele
te redicionará para a página do GitHub.
Ná página do GitHub dê um nome para esse seu novo release. Geralmente
os nomes seguem um formato com três digitos separados por pontos,
chamamos esse sistema de versionamento semântico e
utilizamos ele para controlar as versões de lançamento de acordo com
mudanças que podemos ir fazendo no nosso código. Isso é mais comum de
ser utilizado para controlar versões de pacotes, mas não impede que
utilize a mesma lógica no seu repositório que contém dados e códigos de
análises.
Para lançar seu release basta atribuir um nome de versão para seu
repositório e pronto! Basta clicar no botão para publicar o release e
ele está pronto.
Após isso, volte para a página do Zenodo, lá você vai encontrar
algumas coisas novas ao clicar no repositório que fez o release, a mais
importante dela será o DOI.
Esse número, a partir de agora, identificará seu repositório no
Zenodo. Você pode, por exemplo, adicionar esse número no seu README, de
modo que quem acesse o seu repositório através do GitHub saiba que você
tem uma versão de armazenamento permanente que pode ser acessada através
desse DOI no sítio do Zenodo. Este número também pode ser adicionado na
versão final do seu artigo, juntamente com o endereço eletrônico para o
repositório no Zenodo. Abaixo veja as informações adequadas para
diferentes tipos de documentos e situações
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